需要指出的是，公眾通常習慣于把食品添加劑、農藥殘留、轉基因食品等排列在食品消費風險或損害健康之潛在危險性的最前面，而對食源性疾病這一食品安全方面的最大威脅尚未給予足夠重視。其實，就廣大人群而言，微生物污染才是食源性傳染病中對人健康最大的威脅。這類食源性疾病大多由細菌、病毒、蠕蟲和真菌引起，并且通常都是隱蔽傳導，很難控制，一旦發生就會呈暴發性趨勢。而公眾在食源性疾病發病后濫用抗生素的情況也十分令人擔憂，因為這將導致耐藥菌的日益增加等問題，從長遠看也是對食品安全的一個不容忽視的威脅。